ADMET/2y-projects

(완료) [2506_독성 예측 시각화 & 해석 가능성 테스트] ADMETlab 2.0 활용

MGD 2025. 5. 14. 13:53

<목표>

: ADMETlab 2.0에 SMILES 구조 3개 넣고 결과 비교 후 캡처해서 PDF로 저장

> https://admet.scbdd.com/

 

Home-ADMElab: ADMET Prediction|ADMET Predictor|QSAR|ADMET Database

The main reasons for R&D failure are the efficacy and safety deficiencies which are related in part to absorption, distribution, metabolism and excretion (ADME) properties and various toxicities (T) or adverse side effects. Here, we developed a platform na

admet.scbdd.com

 

 


1단계: 웹사이트 접속 및 준비

  1. 열기 – 브라우저에서 ADMETlab 2.0 웹사이트를 연다. > 열었음

현재 ADMETlab 2.0이  “502 Bad Gateway” 이 메세지가 떠서 메일 보내고 잠정 중단

>> 메일 후 문제 해결

  1. 확인하기 – 'SMILES input' 섹션이 보이는지 확인한다.


2단계: SMILES 구조 입력

  1. 복사하기 – 준비한 SMILES 3개를 하나씩 복사한다.

(대상 선정 완료)

  1. 붙여넣기 – 각 SMILES를 입력란에 붙여넣는다.
  2. 입력하기 – 이름 또는 식별자를 각 구조에 입력한다 (optional).
  3. 추가하기 – "Add Molecule" 버튼을 눌러 3개의 구조를 모두 등록한다.
항목 (용도 / 성질) SMILES
Caffeine (중추신경계 자극제 / 흡수 잘 됨)
CN1C=NC2=C1C(=O)N(C(=O)N2C)C
Acetaminophen (해열진통제 / 간 독성 논란)
CC(=O)NC1=CC=C(C=C1)O
Estradiol (호르몬 / 낮은 수용성)
C[C@]12CC[C@H]3[C@H]([C@@H]1CC[C@@H]2O)CCC4=C3C=CC(=C4)O

 


3단계: 예측 실행

  1. 선택하기 – 예측할 항목(전체 또는 필요한 ADMET 파라미터)을 선택한다.
  2. 실행하기 – "Submit" 또는 "Prediction" 버튼을 클릭한다.
  3. 기다리기 – 결과 로딩이 완료될 때까지 기다린다.

ADMETlab2.0_Caffeine_SMILES.csv
0.00MB
ADMETlab2.0_Caffeine_SMILES.pdf
0.13MB

 

 

ADMETlab2.0_Acetaminophen_SMILES.csv
0.00MB
ADMETlab2.0_Acetaminophen_SMILES.pdf
0.13MB

 

ADMETlab2.0_Extradiol_SMILES.csv
0.00MB
ADMETlab2.0_Extradiol_SMILES.pdf
0.13MB

 

 


4단계: 결과 비교

  1. 탭 열기 – 각각의 결과 탭(Absorption, Distribution, etc.)을 차례로 클릭한다.
  2. 비교하기 – 세 분자의 결과를 나란히 보며 항목별 차이를 비교한다.
  3. 스크롤하기 – 필요한 항목까지 스크롤하여 확인한다.

5단계: 결과 저장

  1. 캡처하기 – 원하는 부분(전체 또는 항목별)을 스크린 캡처한다 (윈도우: Win + Shift + S, 맥: Cmd + Shift + 4).
  2. 붙여넣기 – 캡처한 이미지를 Word 또는 PPT 파일에 붙여넣는다.
  3. 정리하기 – 페이지 배치를 조정하고 결과 비교 설명을 간단히 덧붙인다 (optional).
  4. 저장하기 – "PDF로 저장" 기능을 사용해 파일을 PDF로 내보낸다.

🔚 완료 후

  • 파일명 지정하기 – 예: ADMET_3SMILES_비교_20250514.pdf
  • 백업하기 – 클라우드 또는 외장 저장소에 업로드한다 (optional) >> 구글 드라이브 업로드 완료